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PCR技術(shù)在幽門(mén)螺桿菌耐藥中的應(yīng)用

更新時(shí)間:2022-06-21      點(diǎn)擊次數(shù):733
 幽門(mén)螺桿菌是一種螺旋形、微厭氧、對(duì)生長(zhǎng)條件要求十分苛刻的革蘭氏陰性細(xì)菌,1983年shou次從慢性活動(dòng)性胃炎患者的胃黏膜活檢組織中分離成功。世界上有約一半的人感染了幽門(mén)螺桿菌,但很多沒(méi)有臨床癥狀。幽門(mén)螺桿菌及其患病率在某些人群中高達(dá)80%。幽門(mén)螺桿菌可能通過(guò)接觸感染者的唾液、嘔吐物或糞便傳播,食用受污染的食物或水也會(huì)感染。大多數(shù)感染幽門(mén)螺桿菌的人都是在兒童時(shí)期感染的。
幽門(mén)螺桿菌感染可導(dǎo)致慢性胃炎、消化性潰瘍病(PUD)、胃癌和胃黏膜相關(guān)淋巴組織淋巴瘤等胃腸道疾病。它還可能與非消化系統(tǒng)疾病有關(guān),如口臭、身材矮小、營(yíng)養(yǎng)不良和兒童難治性缺鐵性貧血。根(chu)除幽門(mén)螺桿菌有助于治療慢性胃炎、PUD 和其他相關(guān)疾病,并降低患胃癌的風(fēng)險(xiǎn)。

近期,重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院消化科主任李中躍老師課題組在歐洲兒科醫(yī)學(xué)期刊《European Journal of Pediatrics》上發(fā)表Antibiotic resistance of Helicobacter pylori isolated from children in Chongqing, China的研究論文,研究團(tuán)隊(duì)對(duì)重慶地區(qū)兒童幽門(mén)螺桿菌耐藥性進(jìn)行了分析。

 研究背景

幽門(mén)螺桿菌 (H. pylori) 感染是人類(lèi)最常見(jiàn)的慢性細(xì)菌感染之一,作為幽門(mén)螺桿菌的一線治療方案,標(biāo)準(zhǔn)的三聯(lián)療法包括一種質(zhì)子泵抑制劑(PPI) 和兩種抗生素:克拉霉素和阿莫西林(如果對(duì)青霉素過(guò)敏,可以用甲硝唑代替阿莫西林)。shou次引入該療法時(shí),它達(dá)到了很高的根(chu)除率(> 90%)。然而,近年來(lái)該方案在世界許多地區(qū)的療效一直在下降,根(chu)除<80%,不再適合臨床實(shí)踐。根(chu)除率低的原因可能涉及不適當(dāng)?shù)闹委?、患者依從性差、吸煙、CYP2C19 基因多態(tài)性和胃中的高細(xì)菌負(fù)荷。幽門(mén)螺桿菌對(duì)抗生素的耐藥性通常被認(rèn)為是根(chu)除失敗的主要原因。突變?cè)谟拈T(mén)螺桿菌的抗生素耐藥性中起重要作用。作為zui常用的大環(huán)內(nèi)酯類(lèi)藥物之一,克拉霉素通過(guò)可逆地與細(xì)菌23S rRNA分子50S核糖體亞基的結(jié)構(gòu)域V的肽基轉(zhuǎn)移酶環(huán)結(jié)合,抑制蛋白質(zhì)合成。據(jù)報(bào)道,23S rRNA 基因域 V 中的點(diǎn)突變與克拉霉素耐藥性相關(guān)。A2142G 和 A2143G 的點(diǎn)突變(transtions)是zui普遍的突變。氟喹諾酮類(lèi)藥物通過(guò)抑制 DNA 促旋酶的活性來(lái)干擾細(xì)菌中 DNA 的合成。幽門(mén)螺桿菌對(duì)氟喹諾酮類(lèi)藥物的抗性與 gyrA 基因喹諾酮類(lèi)藥物抗性決定區(qū)的點(diǎn)突變有關(guān)。

實(shí)驗(yàn)方法

幽門(mén)螺桿菌菌株分離:重慶醫(yī)科大學(xué)兒童醫(yī)院消化內(nèi)科門(mén)診對(duì)156例疑似幽門(mén)螺桿菌感染患兒進(jìn)行胃活檢,在調(diào)查前的最后2個(gè)月內(nèi),所有兒童均未服用任何H2受體拮抗劑、PPI、鉍和抗生素。通過(guò)上消化道內(nèi)鏡在胃竇處采集胃黏膜活檢標(biāo)本,樣本經(jīng)處理培養(yǎng)后,對(duì)疑似透明菌落通過(guò)革蘭氏染色和脲酶、過(guò)氧化氫酶、氧化酶活性試驗(yàn)鑒定,然后確定幽門(mén)螺桿菌。

抗生素藥敏試驗(yàn):采用瓊脂稀釋法檢測(cè)幽門(mén)螺桿菌菌株對(duì)六種抗生素(克拉霉素、甲硝唑、左氧氟沙星、阿莫西林、四環(huán)素和呋喃唑酮)的耐藥性。將幽門(mén)螺桿菌懸浮液接種到含有5% 羊血和臨界濃度的單一抗生素的培養(yǎng)板上,然后在微需氧條件下在37°C 下孵育 3 至 5 天??股卣埸c(diǎn)(breakpoints)為克拉霉素≥1.0 μg/mL、甲硝唑≥8.0 μg/mL、左氧氟沙星≥2.0 μg/mL、阿莫西林≥2.0 μg/mL、四環(huán)素≥2.0 μg/mL、呋喃唑酮≥2.0 μg/mL。試驗(yàn)中ACTC11637用作對(duì)照菌株。

23S rRNA 和 gyrA 基因的突變分析:

提取分離菌株的DNA,設(shè)計(jì)引物用于擴(kuò)增23S rRNA 和 gyrA 基因。使用 BIO-GENER PCR 擴(kuò)增儀進(jìn)行PCR擴(kuò)增,最后對(duì)PCR 產(chǎn)物進(jìn)行鑒定,并進(jìn)行 Sanger 測(cè)序以檢測(cè) 23S rRNA 中 2143、2142 位、gyrA 基因中 87 和 91 位密碼子的突變。

統(tǒng)計(jì)學(xué)分析:數(shù)據(jù)采用SPSS 26.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行分析。不同性別、年齡組和內(nèi)鏡檢查結(jié)果的耐藥發(fā)生率采用卡方檢驗(yàn)(χ2 檢驗(yàn)),概率(p)值≤0.05被認(rèn)為具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

其中,基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)中用到的PCR擴(kuò)增儀來(lái)自柏恒科技。


 結(jié)果

研究顯示,共分離出112株(71.8%)幽門(mén)螺桿菌。有56名男孩和56名女孩,所有兒童的平均年齡為9.6±3.0歲,范圍為3.0至17.9歲。112例患者中,最常見(jiàn)的癥狀是腹痛(77.7%),內(nèi)鏡下主要表現(xiàn)為幽門(mén)螺桿菌相關(guān)性胃炎(86.6%),僅有15例患者出現(xiàn)十二指腸潰瘍。在 112 個(gè)樣本中,102 個(gè)菌株檢測(cè)到 23S rRNA 和 gyrA 基因的突變。A2143G突變率為48.0%(49/102);沒(méi)有發(fā)現(xiàn)任何 A2142G 突變。gyrA基因突變率為16.7%(17/102),在17株菌株中,對(duì)應(yīng)Asn87和Asp91的突變率分別為9.8%(10/102)和6.9%(7/102)。研究人員還發(fā)現(xiàn)11株同時(shí)具有23S rRNA和gyrA基因突變。沒(méi)有觀察到 Asn87 和 Asp91 突變之間的 MIC (zui低抑菌濃度)值有顯差異(p>0.05)。

討論

許多國(guó)家都報(bào)道了兒童對(duì)克拉霉素的耐藥性,其患病率從 16.0% 到 50.9% 不等。在該研究中,克拉霉素的耐藥率為47.3%,高于中國(guó)其他地區(qū)以往報(bào)道(16.4-31.8%),但低于北京(84.9-96.6%)。歐洲的一項(xiàng)多中心研究分析了門(mén)診社區(qū)中抗生素使用與抗生素耐藥性之間的關(guān)系,以治療幽門(mén)螺桿菌感染,并表明長(zhǎng)效大環(huán)內(nèi)酯類(lèi)藥物的使用與幽門(mén)螺桿菌對(duì)克拉霉素的耐藥性相關(guān)。在大環(huán)內(nèi)酯類(lèi)中也觀察到強(qiáng)烈的交叉耐藥性。因此,中國(guó)幽門(mén)螺桿菌感染兒童對(duì)克拉霉素的高耐藥性可能歸因于大環(huán)內(nèi)酯類(lèi)藥物在呼吸系統(tǒng)和其他疾病中的頻繁使用。 在臨床實(shí)踐中調(diào)節(jié)和限制大環(huán)內(nèi)酯類(lèi)的給藥可能有利于降低高耐藥性。

重慶市幽門(mén)螺旋桿菌感染兒童對(duì)克拉霉素、甲硝唑和左氧氟沙星耐藥率較高。大多數(shù)克拉霉素耐藥菌株均檢測(cè)到A2143G突變,而gyrA突變點(diǎn)的Asn87和Asp91在左氧氟沙星耐藥菌株中常見(jiàn)。在臨床實(shí)踐中,抗幽門(mén)螺桿菌治療應(yīng)根據(jù)藥敏試驗(yàn)個(gè)體化。

 

在今天的介紹中,我們了解了關(guān)于幽門(mén)螺桿菌耐藥一些情況及背后分子層面機(jī)理,對(duì)于我們預(yù)防和治療幽門(mén)螺桿菌提供了不少信息。分子層面研究可以用到的PCR儀簡(jiǎn)介如下,歡迎咨詢(xún)了解更多。

 

PCR儀產(chǎn)品簡(jiǎn)介

 RePure系列智能二維梯度PCR儀

本系列PCR儀具有二維梯度摸索功能,多種梯度摸索模式;

自適應(yīng)壓桿式熱蓋,合蓋緊蓋一步到位;

前進(jìn)后出式風(fēng)道,機(jī)器可并排放置,節(jié)約實(shí)驗(yàn)空間;

 Q3200系列熒光定量PCR儀

本系列熒光PCR儀采用四通道雙16孔模塊設(shè)計(jì),可實(shí)現(xiàn)一機(jī)多用;

最大升降溫速率8℃/s,大大節(jié)約實(shí)驗(yàn)時(shí)間;

體積小,重量輕,方便攜帶。

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